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DNA重組虛擬實(shí)驗(yàn)(3、制作程序腳本)

【操作開始】
一、準(zhǔn)備酶切目的DNA(RT-PCR的產(chǎn)物)
1、點(diǎn)擊“準(zhǔn)備酶切目的DNA” ----桌面右側(cè)出現(xiàn)DNA, 10×Buffer,限制性內(nèi)切酶, ddH20,左側(cè):實(shí)驗(yàn)儀器:振蕩器,恒溫槽,EP管。
   實(shí)驗(yàn)提示:準(zhǔn)備EP管
 
2、準(zhǔn)備EP管 ----點(diǎn)擊EP管,并拖動至工作臺中央(EP管外顯示刻度0.5ml,1.0ml,鼠標(biāo)置于EP管上,說明框內(nèi)顯示“1.5mlEP管”,3秒鐘后隱去);
      實(shí)驗(yàn)提示:準(zhǔn)備加入目的DNA
 
3、加入RT-PCR產(chǎn)物(目的DNA)---- 1 點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取15ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“20ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至盛有RT-PCR產(chǎn)物處,點(diǎn)擊RT-PCR產(chǎn)物(槍頭內(nèi)顯示吸取15ul紅色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器回到原位置。
實(shí)驗(yàn)提示:下一步選擇兩種限制性內(nèi)切酶。
 
    4、選擇限制性內(nèi)切酶---- 1點(diǎn)擊限制性內(nèi)切酶,出現(xiàn)對話框,出現(xiàn)RT-PCR產(chǎn)物序列:AACGAATTCACAATGGTCAGATCATCTTCT
TTTGGGATCATTGCCCTGTAAGGATCCAAA
及備選擇的5種內(nèi)切酶及各自切割位:SCA I:AGTACT ,
BamH I:GGATCC,
PVU Ⅰ:CGATCG,
ECOR I:GAATTC,
PVU Ⅱ:CAGCTG,
XMN I: GAANNN TTC。
各個酶前面有一個選擇框,點(diǎn)擊即為選擇用。選擇“BamH I”和“ECOR I”提示“選擇正確”,對話框消失,如選擇其他組合提示“選擇錯誤,請重新選擇”。
    實(shí)驗(yàn)提示:加入選中的限制性內(nèi)切酶
 
5、加入限制性內(nèi)切酶----  1 點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取0.25ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“1ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至盛有BamH I處,點(diǎn)擊(槍頭內(nèi)顯示吸取0.25ul紅色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,微量吸液器回到原位置。⑤點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至盛有ECOR I處,點(diǎn)擊(槍頭內(nèi)顯示吸取0.25ul紅色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后EP管蓋子蓋上,微量吸液器回到原位置。
     實(shí)驗(yàn)提示: 加入10×Buffer
 
6、加入10×Buffer ----點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取2ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“5ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至10×Buffer處,點(diǎn)擊10×Buffer(槍頭內(nèi)顯示吸取2ul紅色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,EP管蓋子打開,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到原位置。
實(shí)驗(yàn)提示:加入ddH2O
 
7、加入ddH2O ----①點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取2.5ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“5ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至ddH2O處,點(diǎn)擊ddH2O(槍頭內(nèi)顯示吸取2ul紅色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,EP管蓋子打開,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到原位置。
實(shí)驗(yàn)提示:振蕩混勻
 
8、振蕩---- 1點(diǎn)擊振蕩器,振蕩器出現(xiàn)在工作臺中央。②移動加完樣的EP管至振蕩器上方,③點(diǎn)擊“開始振蕩”,EP管開始在振蕩器上方旋轉(zhuǎn)振蕩,④點(diǎn)擊“停止”,即停止振蕩,振蕩器消失,EP管出現(xiàn)在工作臺中央。
     實(shí)驗(yàn)提示:限制酶酶切
 
    9、酶切---- 1點(diǎn)擊恒溫槽,恒溫槽出現(xiàn)在工作臺中央;3移動振蕩后的EP管至恒溫槽內(nèi),③出現(xiàn)選擇恒溫槽溫度對話框,“1:16℃”,“2:37℃”,“3:42℃”,選擇“37℃”則提示“選擇正確”,對話框消失,如選擇其他則提示“選擇錯誤,請重新選擇”④點(diǎn)擊“開始酶切”,則出現(xiàn)酶切畫面,并出現(xiàn)定時器,時間快速轉(zhuǎn)動,至提示4小時后酶切結(jié)束。畫面顯示有粘性末端的DNA形成,3秒鐘后隱去。
      實(shí)驗(yàn)提示:準(zhǔn)備酶切載體DNA
 
二、準(zhǔn)備酶切載體DNA(質(zhì)粒DNA)
1、點(diǎn)擊“準(zhǔn)備酶切載體DNA(質(zhì)粒DNA)” ----桌面右側(cè)出現(xiàn)載體DNA, 10×Buffer,限制性內(nèi)切酶,堿性磷酸酶,ddH20,左側(cè):實(shí)驗(yàn)儀器:振蕩器,恒溫槽,EP管。
   實(shí)驗(yàn)提示:準(zhǔn)備EP管
 
2、準(zhǔn)備EP管 ----點(diǎn)擊EP管,并拖動至工作臺中央(EP管外顯示刻度0.5ml,1.0ml,鼠標(biāo)置于EP管上,說明框內(nèi)顯示“1.5mlEP管”,3秒鐘后隱去);
      實(shí)驗(yàn)提示:準(zhǔn)備加入質(zhì)粒DNA
 
3、加入質(zhì)粒DNA---- 1 點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取15ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“20ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至盛有載體DNA處,點(diǎn)擊載體DNA(槍頭內(nèi)顯示吸取15ul紅色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器回到原位置。
實(shí)驗(yàn)提示:下一步選擇兩種限制性內(nèi)切酶
 
     4、選擇限制性內(nèi)切酶---- 1點(diǎn)擊限制性內(nèi)切酶,出現(xiàn)對話框,出現(xiàn)RT-PCR產(chǎn)物序列:AACGAATTCACAATGGTCAGATCATCTTCT
TTTGGGATCATTGCCCTGTAAGGATCCAAA
及備選擇的5種內(nèi)切酶及各自切割位:SCA I:AGTACT ,
BamH I:GGATCC,
PVU Ⅰ:CGATCG,
ECOR I:GAATTC,
PVU Ⅱ:CAGCTG,
XMN I: GAANNN TTC。
各個酶前面有一個選擇框,點(diǎn)擊即為選擇用。選擇“BamH I”和“ECOR I”提示“選擇正確”,對話框消失,如選擇其他組合提示“選擇錯誤,請重新選擇”。
     實(shí)驗(yàn)提示:加入選中的限制性內(nèi)切酶
 
5、加入限制性內(nèi)切酶----  1 點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取0.25ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“1ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至盛有BamH I處,點(diǎn)擊(槍頭內(nèi)顯示吸取0.25ul紅色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,微量吸液器回到原位置。⑤點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至盛有ECOR I處,點(diǎn)擊(槍頭內(nèi)顯示吸取0.25ul紅色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后EP管蓋子蓋上,微量吸液器回到原位置。
     實(shí)驗(yàn)提示: 加入10×Buffer
 
6、加入10×Buffer ----點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取2ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“5ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至10×Buffer處,點(diǎn)擊10×Buffer(槍頭內(nèi)顯示吸取2ul紅色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,EP管蓋子打開,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到原位置。
實(shí)驗(yàn)提示:加入ddH2O
 
7、加入ddH2O ----點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取2.5ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“5ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至ddH2O處,點(diǎn)擊ddH2O(槍頭內(nèi)顯示吸取2ul紅色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,EP管蓋子打開,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到原位置。
實(shí)驗(yàn)提示:振蕩
 
8、振蕩---- 1點(diǎn)擊振蕩器,振蕩器出現(xiàn)在工作臺中央。②移動加完樣的EP管至振蕩器上方,③點(diǎn)擊“開始振蕩”,EP管開始在振蕩器上方旋轉(zhuǎn)振蕩,④點(diǎn)擊“停止”,即停止振蕩,振蕩器消失,EP管出現(xiàn)在工作臺中央。
     實(shí)驗(yàn)提示:酶切質(zhì)粒DNA
 
     9、酶切---- 1點(diǎn)擊恒溫槽,恒溫槽出現(xiàn)在工作臺中央;3移動振蕩后的EP管至恒溫槽內(nèi),③出現(xiàn)選擇恒溫槽溫度對話框,“1:16℃”,“2:37℃”,“3:42℃”,選擇“37℃”則提示“選擇正確”,對話框消失,如選擇其他則提示“選擇錯誤,請重新選擇”④點(diǎn)擊“開始酶切”,則出現(xiàn)酶切畫面,并出現(xiàn)定時器,時間快速轉(zhuǎn)動,至提示4小時后酶切結(jié)束。
      實(shí)驗(yàn)提示:加入堿性磷酸酶
 
10、加入堿性磷酸酶----點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取2.5ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“5ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至堿性磷酸酶處,點(diǎn)擊堿性磷酸酶(槍頭內(nèi)顯示吸取2ul紅色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,EP管蓋子打開,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到原位置。
      實(shí)驗(yàn)提示:振蕩混勻
 
11、振蕩---- 1點(diǎn)擊振蕩器,振蕩器出現(xiàn)在工作臺中央。②移動加完樣的EP管至振蕩器上方,③點(diǎn)擊“開始振蕩”,EP管開始在振蕩器上方旋轉(zhuǎn)振蕩,④點(diǎn)擊“停止”,即停止振蕩,振蕩器消失,EP管出現(xiàn)在工作臺中央。
     實(shí)驗(yàn)提示:堿性磷酸酶切除質(zhì)粒DNA5’-末端的磷酸基團(tuán)
 
     12、酶切---- 1點(diǎn)擊恒溫槽,恒溫槽出現(xiàn)在工作臺中央;3移動振蕩后的EP管至恒溫槽內(nèi),③出現(xiàn)選擇恒溫槽溫度對話框,“1:16℃”,“2:37℃”,“3:42℃”,選擇“37℃”則提示“選擇正確”,對話框消失,如選擇其他則提示“選擇錯誤,請重新選擇”④點(diǎn)擊“開始酶切”,則出現(xiàn)酶切畫面,并出現(xiàn)定時器,時間快速轉(zhuǎn)動,至提示4小時后酶切結(jié)束。畫面顯示有粘性末端的載體DNA形成“半環(huán)狀”,3秒鐘后隱去。
         實(shí)驗(yàn)提示:連接反應(yīng)
 
三、連接反應(yīng)
1、點(diǎn)擊“開始連接反應(yīng)” ----桌面右側(cè)出現(xiàn)有粘性末端的DNA,有粘性末端的載體DNA,10×DNA連接Buffer,DNA連接酶,ddH20,左側(cè):實(shí)驗(yàn)儀器:振蕩器,恒溫槽,EP管。
實(shí)驗(yàn)提示:準(zhǔn)備EP管
 
2、準(zhǔn)備EP管----點(diǎn)擊EP管,并拖動至工作臺中央(EP管外顯示刻度0.5ml,1.0ml,鼠標(biāo)置于EP管上,說明框內(nèi)顯示“1.5mlEP管”,3秒鐘后隱去);
    實(shí)驗(yàn)提示:加入酶切后目的DNA
 
3、加入酶切后的目的DNA---- 1 點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取10ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“20ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至盛有酶切后的目的DNA處,點(diǎn)擊酶切后的目的DNA(槍頭內(nèi)顯示吸取10ul紅色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器回到原位置。
實(shí)驗(yàn)提示:加入酶切后的質(zhì)粒DNA
 
4、加入酶切后的質(zhì)粒DNA---- 1 點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取5ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“10ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至盛有有粘性末端的載體DNA處,點(diǎn)擊酶切后的質(zhì)粒 DNA(槍頭內(nèi)顯示吸取5ul紅色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器回到原位置。
實(shí)驗(yàn)提示:加入10×DNA連接Buffer
 
5、加入10×DNA連接Buffer ---- 1 點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取2ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“10ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至盛有10×DNA連接Buffer處,點(diǎn)擊10×DNA連接Buffer(槍頭內(nèi)顯示吸取2ul紅色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器回到原位置。
實(shí)驗(yàn)提示:加入DNA連接酶
 
6、加入DNA連接酶---- 1 點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取0.25ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“1ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至盛有DNA連接酶處,點(diǎn)擊DNA連接酶(槍頭內(nèi)顯示吸取0.25ul紅色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器回到原位置。
     實(shí)驗(yàn)提示:加入ddH2O
 
 7、加入ddH2O ----點(diǎn)擊微量吸液器(說明框顯示“吸取2.75ul液體”,3秒鐘后隱去);2 點(diǎn)擊裝有消毒槍頭的塑料盒(說明框顯示“5ul槍頭”,3秒鐘后隱去),加入到微量吸液器上;3點(diǎn)擊微量吸液器,拖動至ddH2O處,點(diǎn)擊ddH2O(槍頭內(nèi)顯示吸取2.75ul紅色液體);4拖動微量吸液器至EP管處,EP管蓋子打開,點(diǎn)擊微量吸液器(出現(xiàn)槍頭內(nèi)液體注入EP管內(nèi)的畫面),液體注入后,EP管蓋子蓋上,微量吸液器槍頭自動至垃圾桶,微量吸液器回到原位置。
實(shí)驗(yàn)提示:振蕩器振蕩
 
8、振蕩---- 1點(diǎn)擊振蕩器,振蕩器出現(xiàn)在工作臺中央。②移動加完樣的EP管至振蕩器上方,③點(diǎn)擊“開始振蕩”,EP管開始在振蕩器上方旋轉(zhuǎn)振蕩,④點(diǎn)擊“停止”,即停止振蕩,振蕩器消失,EP管出現(xiàn)在工作臺中央。
    實(shí)驗(yàn)提示:恒溫槽連接
 
    9、恒溫槽連接---- 1點(diǎn)擊恒溫槽,恒溫槽出現(xiàn)在工作臺中央;②移動振蕩后的EP管至恒溫槽內(nèi),③出現(xiàn)選擇恒溫槽溫度對話框,“1:4℃”,“2:16℃”,“3:42℃”,選擇“16℃”則提示“選擇正確”,對話框消失,如選擇其他則提示“選擇錯誤,請重新選擇”④點(diǎn)擊“開始連接”,則出現(xiàn)連接畫面,圖中顯示酶切后的目的DNA和酶切后的質(zhì)粒DNA逐漸靠近連接,連接在一起后提示:“DNA重組成功”。
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